巢式PCR是什么意思？

巢式PCR（nested PCR），是指利用两套PCR引物（巢式引物）对进行两轮PCR扩增反应。
在第一轮扩增中，外引物用以产生扩增产物，此产物在在内引物的存在下进行第二轮扩增。
由于巢式PCR反应有两次PCR扩增，从而降低了扩增多个靶位点的可能性（因为与两套引物都互补的引物很少）增加了检测的敏感性；又有两对PCR引物与检测模板的配对，增加了检测的可靠性。
一般应用于动物方面。如：病毒，梅毒螺旋体，HIV，肿瘤基因等

标准Protocol在此：http://www.zoology.ubc.ca/~alorch/konested.htm
此外，还引生出半巢式PCR，多重巢式PCR等等

巢式聚合酶链反应(nested polymearse chain reaction, nPCR)也称套式PCR。在这种技术中，首先用一对外引物进行第1轮PCR，然后再使用第1对引物扩增的DNA序列内部的一对引物再次扩增，所以称为巢式PCR。由于使用了两对引物并且进行了两轮扩增反应，因此试验的敏感性和特异性均增强。在一定情况下，这种方法对减少PCR后扩增产物的污染问题极为有用，但它增加了每次试验的复杂性。为了经济节约，可在第2轮扩增时采用半巢式，设计单条引物，另一条引物与第1轮扩增共用，效果也优于单次扩增。