where are you going

不是，是一般将来时

一般将来时的两种表示方法：
be going to do sth.
will do sth.

一个句子中如果存在这两种情况那么就可以判断为一般将来时。
where are you going这个句子写全就是where are you going to do?

是where are you going to ??还是where are you going to do? ?后句好象没怎么听说过，应该不对吧！
如果作者的意思是要去哪那是前一句，这是一般将来时。

你要去哪里？

going现在时表示将来时，come也是。

在动词中有这种用法，不妨去查查看。

come和go等一些动词用现在进行表将来。eg:I'm coming.

是一般将来时