在支票签发时注明限额,对于超限额很大时,银行有义务拒付吗?

没有，根据票据法，银行是不需理会支票上注明的限额的，所谓支票限额是一点作用都没有的。一般来说，如果支票签发金额比注明的限额大很多，银行工作人员可能会打电话给开户单位确认一下，却并不是义务和责任。