医药公司的利益为何不是来自营业额？那么来自哪里呢？

来自于医药公司付出的劳动力。
这些劳动力有些是您能理解的，有些是您不能理解的。
一切不合理都有其必然存在的必要，因为腐败总比内战好，看的见的腐败比看不见的腐败强，知道腐败的存在比不让你知道腐败的存在好。