转帐的问题

楼上所说的转账支票的做法是错误的。
转账支票没有对方的背书,你是不能把款划入对方账户的.
你老板的意思是让你办电汇.填写一份电汇单子,按其内容把电汇单子填写齐全,在第二联盖上你的银行预留印鉴章,然后把电汇单子送到你的开户行,银行受理后,在第一联盖章后交于你,做为你记账的原始凭证,货款会通过银行划入对方的账户.
基本账户里的钱除了直接划扣和开支票外,还可以办理银行汇票、银行本票、电汇等。

要写转帐支票，用户名称一定要写供应商的全称，票面右上方要写明你们的开户行和账号，写明转帐金额，在票面上加盖公司财务章和法人章，然后送交开户银行。

同时，要附进帐单，左右两侧分别写明你们和供应商的全称、账号和开户行，下面写明金额，将进帐单和支票一起送交你们的开户银行就可以了。银行受理后，会将进帐单第一联加盖受理章后退回给你，你凭这张回单和转帐支票的存根联做为记帐的原始凭证。

另外，如果你们的供应商是外地的，不能填写转帐支票和进帐单，要填写电汇单，然后在电汇单上盖财务章和法人章，送交开户银行，银行受理后退还电汇单第一联给你们做为你记帐的原始凭证。

楼上的已经说的非常清楚和正确了。
我补充一下，你的补充问题，一般来说是都要开支票的，除了像你说的税务局直接扣款，还有办理了委托收款的业务也不用开支票，委托收款就是像代收电费，或电话费这类的，要由收款方和你所在公司和银行签定一个托收协议的。