这种情况如何办理？

如果在北京设立分公司，一般不会有太大问题，根据现行规定，总机构是一般纳税人的，其分支机构可以认定为一般纳税人。
至于是否在外地聘请会计要看当地的税务机关的具体要求；北京分公司是否需要专职会计要看各区的要求，想海淀就要求必须有专职会计，找财务公司都不行的。
不设立分公司，也可以在北京开展业务，但是就是开具发票必须由外地的公司开了。
在北京开分公司，不会出现缴纳两份税的情况，增值税各交各的；企业所得税可以申请总分机构汇总交纳。