这样会导致头痛吗

从科学和理性的角度分析，绝对不会！
甩头运动的是颈部关节，即使次数太多了要引起疼痛，那也该是疼在脖子上。如果说头部运动会震动着颅腔里面的脑组织，那更是子虚乌有。我们活着就得运动，而人一生运动得最多的就是头部，假如头部运动会“震着脑子”引起头痛，那还不满世界全是头痛病人？
你这个极有可是“血管神经性头痛”，建议到正规医院咨询专业医生，查明病因以后再采取有针对性的措施。