在理论上，将读卡器装在鼠标里是否可行？

应该可以，前提是你的鼠标够大，塞得进去读卡器的电路板和接口。
把进鼠标的USB线换成优质的USB延长线（细线），因为鼠标原配的线有点细，不好分线，每根都分成两股，共分出4x2=8根。一套接鼠标，另一套线接读卡器的电路板，然后在鼠标上开对应得孔就可以了。这样接是并联电路，理论上是互不干扰的。接线要用电烙铁焊好。
串联的话就需要转换开关了。这个没必要串联，麻烦。

如果是用USB接口的可以，但是用PS/2的难说

可能行，因为都是5V。

USB的鼠标要再加装微动开关,否则在加装读卡器的时候,就要有硬件冲突!<接通读卡器的时候能断开鼠标>,因为鼠标内也有硬件识别的芯片!