肽链中的游离羧基是不是只有一个

当然不是.首先要清楚氨基酸的结构.中心碳原子、氨基、羧基、氢、还有一个不确定的R基，问题就在这，参加脱水缩合的是氨基和另一个氨基酸的羧基，R基是不反应的。如果R基是羧基，那么生成的肽链就含有不止一个羧基啦。

至少要有一个

不一定，其它支链上也可有羧基，但至少要有一个。