银行是怎样运作的

首先要看你的账号是本地还是你朋友所在的外地，如果是本地账号，你朋友给你存钱的时候除非执有你的存折或者卡，如果有，则不存在手续费的问题，如果都没有则算为汇款，如此一来一般会向你朋友收取手续费，如果单纯从中间业务增量计算，的确外地银行赚了，但是你要说是本地银行亏了？这点难以举证，举个简单例子，国内存款过于庞大，存款数额过剩而导致市场资金流通不畅是近几年中国资金货币市场的现状，在经济高速发展的今天，争取发放优质贷款是主题，如果本地银行减少了存款，则相对庞大的存款基数影响不大，但是却减少了利息负担，因为你存在银行的钱少了，相对需要付给你的利息也少了，而现今银行存款头寸太大，不需要太多的存款，虽然自去年曾经加息，但是对于这一状况改善尚不明显。
如果你的账号是你朋友所在的外地，则以上分析可相反套用，一般区别在于，你朋友汇款给你的时候不需要付手续费，而是你在取款的时候需要付异地提款手续费。
也有一些银行免受异地存取款手续费，则另当别论，总结如上，鄙人浅见，勿见笑。。。

银行内部有结算制度，你杞人忧天了
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别忘记还有个银行叫中央银行，另外银行间有票据结算中心的

不明白你说“赚和亏”的问题，如果你是说手续费的问题，从表面上看是你取款的银行亏了，为你免费服务了，但是也有人通过他们向外地汇款啊；而为你存款的银行是赚了手续费，但是也有人在通过他们收取汇款。
关于你说的问题补充，银行在日终结算时会通过自己的“通存通兑”账户还平衡你说的这种情况的。