请问通过高考上的军校和在部队考的军校,在部队里有什么不同吗?

这个不一定
从地方高考的，一般是初级指挥院校和技术院校，前者一般是专科、后者多是本科，毕业后分别授予少尉、中尉军衔
而从军队考上的，则多是初级指挥院校和士官学校，很少有技术院校，而士官学校虽然也大多是大专层次，但出来是中级士官，不是军官

待遇一样的。。

不过部队走的基本是指挥类的（也就是前线打仗的）而从高中直接走大部分都是专业类的（就是研究某某先进武器等）

还有就是部队的一般文化水平都不高（你想想要个书生去打仗，那不败才怪！）

基本待遇相同,个发展主要看个人能力

待遇都是一样的!