我的电脑里居然有40多万个文件！我想进行清理，却不知道哪些是没有用的，哪些是有用的，请问怎么办？

这是你的电脑用得久了.并不是中毒所产生的原因.首先可以删除一些不要的文件,再整理一下碎片(打开我的电脑,C盘我的属性,碎片整理).
玩游戏时都有用户名的,找到游戏的安装目录,删除以用户名为文件的目录.
最直接的方法可以删除C盘中的临时文件(也就是垃圾文件),具体操作:
打开"我的电脑"－"工具"－"文件夹选项"－"查看"－在"显示所有文件和文件夹"选项前打勾-"确定"

删除以下文件夹中的内容：

C:\Documents and Settings\用户名\Cookies\下的所有文件(保留index文件)

C:\Documents and Settings\用户名\Local Settings\Temp\下的所有文件

C:\Documents and Settings\用户名\LocalSettings\TemporaryInternet Files\下的所有文件

C:\Documents and Settings\用户名\Local Settings\History\下的所有文件(历史纪录)

C:\Documents and Settings\用户名\Recent\下的所有文件(最近浏览文件的快捷方式)

C:\WINDOWS\Temp\下的所有文件

C:\WINDOWS\Prefetch\下的所有文件

删除系统文件备份
在系统文件中的"system32\dllcache"目录里，有将近250MB的文件，它们是Windows?XP系统文件的备份。当Windows XP的系统文件被替换、删除或修改时，Windows XP可以自动从中提取出