在影子系统上Q会影响QQ的活跃天数或QQ对战的积分吗?

不影响，我也用影子系统！而且最近一直玩QQ四国军旗，对积分没有影响，跟QQ活跃天数以及对战积分有关的信息都是保存腾讯的服务器端，只是如果在影子系统下，如果你跟别人聊天了，重启电脑后，那些聊天纪录没有了！

不会。只要是对于网站服务器上的操作，不管你用哪个影子模式都不会影响的。