农资经营机构,经营品种有农药,总公司已办理有关危险化学品经营许可证,想问一下分支机构还需要在各地办理吗

十分荣幸的告诉你,这是需要的.
你的总公司通过评估并不代表你的分支机构也能通过评估并符合国家有关规定,所以必须要在各地的安监部门办理危险化学品经营许可证.
最后告诉你(农市发<2003>16号)文规定的具体内容是什么我不知道但是你可以参照下:
<危险化学品经营许可证管理办法><危险化学品安全管理条例>
如果还是不清楚可以在当地的安监部门询问下具体事宜.

建议查一下工商局的各项管理规定