C盘分区为FAT 重装系统时可以使用NTFS文件格式化磁盘分区吗

可以。不过建议你C盘用FAT32格式分区，因为兼容性好，其余分区用NTFS的，因为安全性高，最重要的是支持单个4G以上的文件存放，FAT32不支持。

当然可以，不过要注意WIN ME以下的WINDOWS版本不支持NTFS

NTFS：微软Windows NT内核的系列操作系统支持的、一个特别为网络和磁盘配额、文件加密等管理安全特性设计的磁盘格式。随着以NT为内核的Windows 2000/XP的普及，很多个人用户开始用到了NTFS。NTFS也是以簇为单位来存储数据文件，但NTFS中簇的大小并不依赖于磁盘或分区的大小。簇尺寸的缩小不但降低了磁盘空间的浪费，还减少了产生磁盘碎片的可能。NTFS支持文件加密管理功能，可为用户提供更高层次的安全保证。不过FAT32的读写速度比NTFS要快，所以选什么要看你怎么用了。