为什么他会这么不高兴

每个上司都喜欢自己的下属巴结自己,你虽然和部门经理挺情投意合,但是不是也应该也和你的上司没事也投缘一次,看看他的情绪有所改变没,要处好自己与每个上司的关系,否则你就是不想要自己的饭碗了,你与部门经理谈的来,可以下班时间或业余时间在不用看别人脸色时约在一起聊个够

可能上司不喜欢这种类型，你应该换种风格

嫉妒了呗！
当他看到你们关系这么好，而忽视了他，就把这种气愤发泄到你们三人中职位最低的人身上，你就成了他的出气筒了。唉！可怜的人
既然你们的上司气量这么小，你就要注意了。当着这位上司的面时，你就要和部门经理保持距离，平时还和过去一样。毕竟胳膊拧不过大腿！！
也可能如楼上所讲，上司喜欢和你独处，喜欢让你做事情，而讨厌那个部门经理，他不想让自己喜欢的人和自己讨厌的人在一起，才会这样。不过，我觉得这种可能不大。
你以后为了自己不再挨骂，可以改变一下处事方式，自己观察一下属于哪种情况就明白了

我倒觉得，没什么喜欢不喜欢的因素
每个上司都是这样的。
第一、每个当官的都希望大家去巴结他，而且只跟他一个人好，而你很明显违反了这一条；
第二、一个部门经理和一个职员很要好，就容易生成小团体，不利于你们的上司管理，这点你要体谅他的。
虽然你们并没有要搞什么小团体，但是你们的上司就不会这么想了，他甚至会怀疑你们在搞什么阴谋诡计也说不定的。这种事情是没有办法的，如果你不愿意去巴结你的那个上司的话。

你上司心情不好吧

这其中的奥妙你还要多观察