准生证的办理及小孩的出生一定要在同一地方吗？？？

无稽之谈。
你老婆没有在户籍地办理《准生证》，没有户籍地的生育指标是正常的。只要小孩出生后到办理《准生证》的地方落户就可以了。
不属于违规生育，更不应该吓到不敢出门。为了孕产妇的健康和你的小孩，应该让夫人多多锻炼：）
个别地方、个别计划生育工作人员学习法律、落实政策不到位，才会造成这样的局面。请他们加强学习。