我是在农村办的加工厂,现工商局按百分2收管理费,包括发给员工的工资,这样合理吗?

是合法的。
其实不管你做什么生意都该缴税。
建议你到工商所办理一个个体工商户，然后每月交纳工商管理费，费用是根据你的经营范围规定的定额。不同的经营范围缴纳的管理费也是不一样的。

但这样做的好处是工商局没法按照你的收入征收2%的管理费，你赚多赚少和他们都没有关系。最关键的是你可以申请减免管理费，说你的经营不好，把管理费压到最低。

因为他们说收你的2%的管理费，其实已经当于让你做了个体工商户，不如自己注册一个，把主动权握在自己手里。