请问学校在什么情况下才会只给硕士或者本科发“肄业证”而不是发“毕业证”？

规则硕士和本科的差不多：

凡受记过以上处分的学生,在毕业前未撤销处分者,不发给毕业证书,只发肄业证；
未修够学分的，不发毕业证,只发肄业证；
勒令退学的学生，只发肄业证；
毕业论文答辩未通过的,不发毕业证,只能发结业证。

具体规定各个学校有所差别。