电动车48V充电器能否同时冲2个电池

不可以，这样会严重损害电动车的电瓶。
常用电动车充电器根据电路结构可大致分为两种。第一种是以uc3842驱动场效应管的单管开关电源，配合LM358双运放来实现三阶段充电方式。还有一部分充电器也具有防反接，防短路的功能，其原理与第一种不同，其低压电路的启动电压由被充电池提供，且接有一个二极管（防反接）。待电源正常启动后，就由充电器提供低压工作电源。这种充电器的控制芯片一般是以TL494为核心，推动2只13007高压三极管。配合LM324（4运算放大器），实现三阶段充电。

你说的方法不可取：
充电器的要求是电流的限制，因为并联分流，你原来充电器的电流会造成输出电流的不足，造成充满电的假象，影响电瓶的储电量及使用寿命，另外在充电的同时，以为是一个端口人为的分成两个，输出电流肯定会过大，造成线路的过热，严重时会自燃，产生危险，为了安全，建议不要用此方法。
你可以把两个充电器的端口都分到楼下，分别各自使用，这样虽然麻烦，但是安全，对电动车的蓄电池也是一种保护。

没关系,可以冲,这不是并联,是穿联

可以充。
但你原来的充电器就不知道行不行了。
可用并联充电，分两个电池组。
对充电器的要求是电流的限制，因为并联分流，你原来充电器的电流可能不够。要不行你可以买一个大一点的充电机。
电动车电池一般是12---22AH的，充电机买到10A的就可以了。如电池组上48V的就买48V，36V就买36V的。