怎样用NCBI的FTP下载某物种的EST序列

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/05/10 11:04:10
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genbank/
中全是数字编号,看不出是哪个物种

ncbi ftp站点只有三个数据库 est_humanfasta,est_mouse.fasta,est_others.fasta.想获得某一物种的est库 可以到ncbi taxonomy主页输入物种名 页面有上角 就会出现该物种的详细信息,里面有EST记录 如果记录数目较大点击即可获得该物种的EST库

另外还可以从最近日期的blast数据库中est_others.fasta中用grep命令提取特定物种的est