一般纳税人企业可以同时申请使用两种最高限额专用发票

不可以，只能申请最高限额，然后在限额内开具，也就是可以低于限额但不能超过限额开具发票。

税务机关会在开票限额批准后，在你的开票系统内作好限定，你根本不可能超限额开具发票的。

不可以。最高限额只有一个，申请之后购买的所有专用发票都是这一限额，税务局是不可能给企业两种限额发票的。