直辖市的检察院是如何划分的?

那是按片划分的。
比如在北京，北京市人民检察院下辖第一分院、第二分院、北京铁路检察分院和十八个区、县检察院。
北京市人民检察院下辖三个分院，分别为北京市人民检察院第一分院、第二分院和铁路运输检察分院。

在北京市18个区县均设有基层检察院，按照地域关系分别接受一、二分院的业务指导。这个所谓的地域关系就是按东西两片划分。

铁路运输检察分院下辖三个基层院，即北京、天津、石家庄铁路运输检察院。