FOB可以报人民币吗?报人民币是不是代表我们把退税的权利交给对方了?

楼主没交代清楚。
如果向外商报价，报什么币种只要对方同意，随便你报。
如果向外贸公司报价，如果是人民币价，由外贸公司出口，那退税权就在外贸公司一方。

可以。与东南亚国家的边贸就算是人民币结算的。只要报关单和核销单在你的手里，退税的权利就在你的手里。