在化学变化中保持物质的最小微粒是分子还是原子还是离子

三者皆是
分子如CO2
原子如铁
离子如氯化钠溶液中的钠离子和氯离子

分子

原子
化学反应讨论到原子

原子

如果是初中化学，保持物质化学性质的最小单位是分子（化学书原话），当分子被打散成原子进行重组，就不能再被称为反应前的那个物质。

如果是高中化学，化学课本里没有提到这个问题，而且此问题并不重要。
但就晶体结构一章来看：
对于多原子分子晶体，答案同上；对于单原子分子晶体，如惰性气体，实际保持物质化学性质的是原子，但由于是单原子分子，因此还应说成分子。
对于离子晶体，由于电离是物理变化，你可以把反应前的电解质溶液中的离子看作保持物质化学性质的最小单位。
对于原子晶体，只要没有破坏共价键，你可以把原子看作保持物质化学性质的最小单位。
对于金属晶体，这点不好讨论。事实上金属晶体是由阳离子和自由电子组成的。

在初等学习中有很多概念是随着认知的变化而有所改动甚至废弃的。所以你可以根据你年龄的需要进行筛选。剩下的作为拓展。