IE中了木马或插件，他的哪些程序被破坏了？

没有损坏什么
IE中了木马或插件，是这些插件（木马其实也是通过某个功能dll模块对IE进程进行了插入）通过对IE进程的插入，使其自身的功能得以实现了。
说得白一点就是对IE进行了寄居了。
IE本身的功能模块没有被损坏