为什么清朝有12个皇帝却有13个年号?

因为皇太极有两个年号——天聪，崇德。 皇太极即位时还是大金（后金），年号天聪。后将国号改为大清，改年号崇德，改族名为满州。
（太祖）爱新觉罗*努尔哈赤 年号天命
（太宗）爱新觉罗*皇太极 年号天聪
（世祖）爱新觉罗*福临 年号顺治
（圣祖）爱新觉罗*玄烨 年号康熙
（世宗）爱新觉罗*胤祯 年号雍正
（高宗）爱新觉罗*弘历 年号乾隆
（仁宗）爱新觉罗*永琰 年号嘉庆
（宣宗）爱新觉罗*绵宁 年号道光
（文宗）爱新觉罗*奕宁 年号咸丰
（穆宗）爱新觉罗*载淳 年号同治
（德宗）爱新觉罗*载恬 年号光绪
爱新觉罗*溥仪 年号宣统

天聪"和"崇德"

皇太极做了两件大事，影响千古，史册永存。一件是改族名女真为满洲。天聪九年(1635年)十月十三日，天聪汗皇太极发布改族名为满洲的命令，从此，满洲族(简称满族)的名称正式出现在中华和世界的史册上；另一件是改国号大金为大清。天聪十年(1636年)四月十一日，皇太极在沈阳皇宫大政殿举行即皇帝位的典礼，改国号“大金”为“大清”，改年号“天聪”为“崇德”。因为皇太极有两个年号：一个是天聪，另一个是崇德，所以清朝出现十二帝十三朝的现象。皇太极改国号、称皇帝意在表明：自己不仅是满洲的大汗，而且是蒙古人、汉人以及所有人的大汗，是大清国臣民的皇帝。

因为努尔哈赤 天命汗爱新觉罗·努尔哈赤(1559—1626年)，女真族，后金政权创立者。明万历四十四年（1616年）正月，在赫图阿拉称“覆育列国英明汗”,年号天命。在位11年

皇太极

天聪汗爱新觉罗·皇太极（1592—1643年)，努尔哈赤第八子，满族。天命十一年(1626年)九月，继后金汗位，以次年为天聪元年。天聪十年（1636年）四月，皇太极在沈阳称帝，建国号大清，改年号为崇德，并以是年为崇德元年。
从此清才有帝位

我记得是同治吧，刚刚刚刚即位时有一个年号，后来慈禧慈安同治朝廷，于是改名了（也就是说同治皇权有限）

那是因为清太宗皇太极有两个年号——天聪、崇德。

1626年皇太极即位，成为后金