我把C盘我系统备份，有在C盘重装了个，但是把备份的恢复在D盘为何没法用？只能C盘的~望大侠指导小弟

这样做当然不行。。
首先C盘要装低版本的。其他盘要装高版本的（如果不是这样的话要更改启动文件等等之类的麻烦）不是说不行是比较麻烦
针对你的问题。你可以把C盘的BOOT.INI文件做以下修改：
[boot loader]
timeout=3
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional" /noexecute=optin /fastdetect
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\WINDOWS="Windows Server 2003, Enterprise" /fastdetect /noexecute=alwaysoff

以上只是举例子：因为我装在C盘的时xp，D盘的是2003
[boot loader]
timeout=3 （这个是开机时3秒的等待时间可以选择进那个系统）
default=multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS （默认启动的系统XP如果不进行选择3秒后就登陆硬盘第一分区的系统）
[operating systems]
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(1)\WINDOWS="Microsoft Windows XP Professional" /noexecute=optin /fastdetect（在C盘上的XP）
multi(0)disk(0)rdisk(0)partition(2)\WINDOWS="Windows Server 2003, Enterprise" /fastdetect /noexecute=alwaysoff(在D盘的2003）

相信能帮到