迷你机箱与其他机箱在功能上有有什么大的区别？

区别最大的当然是体积了，非常明显，一眼就能看出来。虽然体积算不上是“功能”上的区别，不过迷你机箱与普通机箱功能上的区别最终都是由体积导致的，暂且这么说吧。
迷你机箱由于体积比较小，因此迷你机箱可以容纳的硬件少一些，直接导致的结果就是迷你机箱的扩展性稍差。比如普通机箱一般至少带有3个5.25英寸（光驱或与之相同尺寸）的设备安装位，迷你机箱通常仅为一个；3.5英寸（硬盘、软驱或与之相同尺寸）设备安装位普通机箱一般至少有3个，有较多的产品为方便用户达到了5个，迷你机箱一般只有1到2个；背后的扩展接口普通机箱一般为6个，用来安装PCI、AGP或PCI-E设备，迷你机箱则无法达到这么多，具体可用的数目还要取决于主板。迷你机箱为了达到缩小体积的目的不得不减少各种设备安装位的数目，无法容纳太多的设备，也就限制了它的扩展性。同样受限于体积，像GeForce8800GTX这样怪兽级显卡的庞大身躯，迷你机箱甚至一个都装不下。如果你拥有比较多的硬件，比如两个甚至更多的光驱、硬盘，或干脆连软驱都保留着，再或者有一个大功率显卡，即便你能把这些硬件全都塞进去也不推荐你用迷你机箱。还有一个不能忽视的问题就是散热。
散热性比普通机箱差也是迷你机箱的小体积惹的麻烦。在迷你机箱里，各种硬件的安装必须更紧凑一些，开机后升温快，提供给空气流通的空间较小，热空气不容易散出去。如果你用的是Pentium4或PentiumD这种发热量跟电熨斗几乎在一个水平上的CPU，那你最好也不要考虑迷你机箱了。否则死机或由于温度过热CPU自动降频导致系统反应迟钝会令你无法忍受，特别夏天更为明显。
光说缺点去了，迷你机箱的好处也是显而易见的，那就是占用的空间小，放在办公桌上可以腾出更多的空间放置其它物品。要是我们使用的时候需要搬动，迷你机箱当然更省事些。如果你想组建一台多媒体电脑放客厅里，普通机箱那硕大的身躯放电视旁边看上去肯定不顺眼，采用迷你机箱或经过专门设计的HTPC就会和谐得多。

功能上没有什么区别，就是大的主板安装不上。

没有区别，只是所用主板的大小有区别，主办上的元件相对集中，如果LZ不使电脑安放空间不足或者为了追求美观的话不建议使用小机箱，因为其不利于散热。