报到的单位和报到证上备注一栏上写的不是同一家企业，这样会影响申报户口吗？

要换报道证，否则新单位没办法调入你的档案。
应届毕业生在没毕业之前找到工作的，要和用人单位、学校签订一个三方协议，等到修完学业准予毕业后，学校会按照三方协议上的接受单位到人事局办理报道证以及寄送档案。
所以你换了单位后，要取回和原单位签订的三方协议（如果三方协议里有规定违约金，那还需要支付违约金），并退回学校才能重新与新单位签订协议。