我请问一下台湾在秦汉时期称作什么?或者在秦朝以前称作什么?它又是在什么时期才纳入中国领土的?

秦朝时国土还没到台湾，只是“东邻大海”而已。

而且中国真真正正和台湾融为一体恰恰是在元朝， 元朝在澎湖设“巡检司”来管辖台湾〔当时叫“琉球”〕
虽然两岸早有联系，但是台湾真正规中国管辖还是在800年前的元朝！！

远古时代，台湾与大陆相连，后来因地壳运动，相连接的部分沉入海中，形成海峡，出现台湾岛。在中国古代文献里，台湾被称为“蓬莱”、“贷舆”、“员峤”、“瀛洲”、“岛夷”、“夷州”、“琉求”等。
早在三国时期，吴国就派将军卫温率万人船队到达夷洲，即今台湾；

在三国时期，吴国就派将军卫温率万人船队到达夷洲

琉球