什么是rep-PCR

Rep-PCR：Versalovic于1996年描述的一种细菌基因组指纹分析方法，即细菌基因组重复序列PCR技术（rep-PCR）是扩增细菌基因组中广泛分布的短重复序列，通过电泳条带比较分析，揭示基因组间的差异。细菌基因组中广泛分布的短重复序列（repetitive sequence），包括常用的REP（repetitive Extragenic Palindromic,基因外重复回文系列）、ERIC（肠杆菌基因间重复一致序列）和BOX，它们在菌株、种、属水平上分布有差异及进化过程有相对保守性。Rep-PCR目前发展迅速并被广泛应用于多种细菌基因分类，此方法操作方便，可以大样本进行。REP-PCR分辨效果好，可重复性强，比 RFLP、生化分型，核糖体分型要好。REP-PCR目前可自动化分型，并可建立各种细菌REP、ERIC-PCR分型标准数据库。

PCR是DNA的体外扩增技术.

PCR(聚合酶链式反应)原理
PCR是体外酶促合成特异DNA片段的方法，主要由高温变性、低温退火和适温延伸三个步骤反复的热循环构成： 即在高温（95℃）下，待扩增的靶DNA双链受热变性成为两条单链DNA模板；而后在低温（37～55℃）情况下，两条人工合成的寡核苷酸引物与互补的单链DNA模板结合，形成部分双链；在Taq酶的最适温度（72℃）下，以引物3’端为合成的起点，以单核苷酸为原料，沿模板以5’→3’方向延伸，合成DNA新链。这样，每一双链的DNA模板，经过一次解链、退火、延伸三个步骤的热循环后就成了两条双链DNA分子。如此反复进行，每一次循环所产生的DNA均能成为下一次循环的模板，每一次循环都使两条人工合成的引物间的DNA特异区拷贝数扩增一倍，PCR产物得以2n的批数形式迅速扩增，经过25～30个循环后，理论上可使基因扩增109倍以上，实际上一般可达106～107倍。