每次开机都要检测一下C盘，和NTFS系统有没有关系啊？

有硬盘坏道,用系统自带的工具检查一下,它会自动修复你硬盘的逻辑坏道。
单击硬盘右键,属性,工具,开始检查.
还有你要经常整理一下硬盘碎片.最好在晚上的时候整理,不能一边整理一玩打电脑的,这样整理的效果不好而且影响你的操作(机子速度会变慢).几天整理下来你的电脑就会灵活起来了.
也可能是病毒引起，也要注意防毒杀毒.记注防毒才是第一，而杀毒才是第二。
等你中毒的时候你会体会到的。
所以杀毒软件一定第一要选防毒性能好，然后再去考虑它的杀毒效果。卡巴它虽然杀毒强，但它的防毒功能模块既占用电脑的内存而且很影响机子的运行速度，所以不要去装它，这是我个人意见，也是我亲身体会到的，其他杀毒软件最好用国内的，建议用金山，用它你会感觉到机子速度和没用装的一样，而且占用少量的内存，用起来也很方便，防毒能力非常强。

没关系 用优化大师把检测关了

和NTFS没关系.我的是FAT32也是.过几次就没事了