我把收入还了短期债务怎么记账呢，

收入抵支出？那是坐支，是不符合财务规定的。
应该是：
取得收入时：
借：银行存款
贷：主营业务收入（其他业务收入）
利润表增加主营业业务收入项目
资产负债表增加银行存款项目
（资产增加、利润暨所有者权益增加）
还短期借款时：
借：短期借款
贷：银行存款
资产负债表减少银行存款项目、减少短期负债项目
（资产减少、负债减少）
现金流量表
经营活动产生的现金流量增加
筹资活动产生的现金流量减少

胆够大的