请问在安全模式下打开带毒的U盘会不会被感染呢？

绝对会！
另外：“按道理说说有的程序在安全模式下都是不能够正常运行的”毫无道理，应该是大部分程序都可以运行

会的，只不过在安全模式下U盘里的病毒不会自动运行。你打开应该会中毒。一般你打开U盘用右键打开，不要双击或右键选择autorun.右键选择打开没问题，你先打开卡巴杀毒嘛。