c# 自带打包工具

Visual Studio 自带的打包工具还是挺好用的，我的版本是2008，不知道你的是什么版本，总之我这边没有出现过你说的现象，可以自由选择安装路径的。也许是创建打包项目时某些配置的关系吧，反正我都是默认，什么都不改，那样是好的。

上网查C#程序打包，一大堆了

你用的应该是发布，而不是制作安装项目。在新建项目里找下：其他项目类型—〉安装和部署。