现我家准备建第二层，应如何去办理手续。以后房产证如何处理？

向房管局申请改建，如果批准，可以重新颁发房产证。

办理不了，因为这种情况出现的事故比较多．设计荷载是按照一层来考虑的，地基承载力不一定能够（假如你这个有设计图纸）
如果是自己家盖民房我建议你不要说加二层，等建好以后，直接去办理房产证．就是说都是新建的，原来的拆除了！