我注册了一公司，一公司欠我公司货款以房产抵偿，但只能转到公司账户上，把房产转入我个人户，账怎么走？

一种处理方法是,房子直接过户到你的名下,否则先到你公司再到你个人转好几道手的契税要交好多.房子就算是你买的了.你公司挂的对方公司的往来账,以协议方式或现金走账的方式把它平掉,在你公司账上挂你的个人往来款(算你欠公司的钱).此过程相当于:公司借钱给你----你用这笔钱去买房子,对方公司取得这笔钱后作为还货款付给你公司.
这种处理方法有一弊端,按你的叙述,你很可能是公司的股东,按现在个人所得税的实际操作,股东长期占用公司的钱是要视为分红所得,交纳个人所得税的.你在公司的个人往来款挂账最好在一年时间里,通过发票报销等手段把它平掉.
二,设法取得一张金额相当的业务发票,以支付货款的名义将款项从公司汇出,再将该款汇回你的公司,将挂账平掉.

补充:一是可以分期付,基本账户或一般户都可以.二,如果开票人和你关系好,转账过去再现金取出来,借用一下他的账户.