木管五重奏没有双簧管能不能用另一只长笛代替啊？

可以啊，长笛和双簧管都是C的，谱子通用的。
不过效果会差一点，因为木管五重奏原本已经有一支长笛了，现在再用一支长笛代替双簧管，这两支长笛的音色可能会混淆在一起，使得乐曲的声部感和层次感有所下降。