开1000元的电脑配件报销发票，卖方索要5.5%的发票税是否合理？

这个肯定是不合法的.
至于合理不合理么.市场上目前就这样.要发票就得给人家税钱.都成了不成文的规定了.

不合理 可以向它所属的税务局投诉

合理不合理，自己看着办；合法不合法，找税局去！

商业产品销售按4%征收增值税
维修修理\修配按6%征收增值税,
卖方的做法不同,到当地国税部门去举报他.