克隆人是否合法由哪个机构决定

当然是立法机关了，在我国是人民代表大会。人大制定的宪法和法律里，规定不能克隆人，那就是违法的；如果哪天人大讨论通过了可以克隆人，那么克隆人就合法了。
克隆人的过程对于克隆人的生命健康存在着情节严重的伤害行为，这是违背宪法、刑法精神的行为。就我国而言，国家实行计划生育，人类自然生产都在限制之列，为什么还要进行另一种人口生产的实验。何况，我国人口的自然繁衍生育能力很强，绝对没有必要通过克隆方式创造人口。因此，在我国克隆人的研究是违背《计划生育法》的做法。