农业银行的网上银行可以进行对深圳发展银行的跨行转账还款吗？

可以的

不过 你要先用金穗通宝卡开通农行网上银行 之后才可以对深发展进行跨行转账汇款

以下是农行跨行转账汇款的费率:

农行网银跨行转账：
同城：
5000元以下 2元/笔 5000元-50000元 3元/笔
50000-100000元 5元/笔 10万元以上 8元/笔
异地：
转账金额的0.5% 最高35元 最低1元

同城跨行转账：
1万元以内收取3元 1-10万元收取5元
异地跨行转账：
1万元 10万元都是35元

可以，要收转帐手续费。