请问现在一般纳税人一年会被查几次帐?都是哪些单位来查的?

说不定。
一般有政府机关管理部门如：国税局、地税局、工商局等等。
还有就是企业的上级管理部门或上级管理部门委托的中介事务所，如：会计事务所。
再有就是企业自己的内查，或聘请的会计事务所。
还有就是各政府机关的某一事项要求企业找事务所清理的，如：税务局的所得税汇算清缴企业清税务事务所做汇缴清理等等。
反正名目繁多，小企业查账不多，上一点规模的就多了，国有企业更多。

这个好像不是固定的吧,每年税务稽查局似乎都会抽查,有的几年也碰不到,有的一年碰几次,有国税市局,国税稽查,地税稽查....