结石从尿道口取出后,阴茎根部疼痛 ????急...

这是正常现象，你也说是很大的结石嘛，可能是在排石的过程中造成尿道的损伤，你排尿的时候就会刺激到尿道，所以感到有些疼痛
就像是我们手破了点皮碰到水会很痛一样的道理
有些人可能还会有血尿的出现，不是很严重的话是没有关系的，只要不感染，一般问题都不是很严重的，去医院可能也是给你开点消炎药之类的。

结石病应选择性治疗：
结石病是一种常见多发疾病，结石可以发生在胆道及泌尿系的多个部位，例如，肝内胆管、胆囊内、胆总管、肾、输尿管、膀胱、前列腺等部位。临床可出现结石部位绞痛、钝痛、黄疽、血尿、尿痛等，患者为此受到百般折磨。有的还不止一次地接受过手术治疗，有的长期接受药物治疗，有的更经过多种治疗后仍反复发作已经丧失了治疗信心，这些都影响着群众的身心健康，因此找到一种切实可行，高效对症的治疗方法是治疗愈结石病的关键，不但减轻患者的身体痛苦和经济负担而且可以有效杜绝结石病所产生的多种严重的甚至危及生命的合并症，后遗症，使治疗不走弯路，起到了事半功倍的作用。
结石病的常规疗法分为手术疗法与非手术疗法（排石、溶石、碎石）。手术疗法一般是患者经过多种长期的非手术疗法治疗无效后才采用的一种治疗方法，但由于创伤重，风险高，花费大、痛苦重，合并症后遗症多，患者往往望而生畏难以接受。
结石病在非手术疗法中，中药排石疗法“总攻疗法”对于较小的结石颗粒有一定的疗效，主要是受局限于结石的排石通道过于狭小（胆道开口仅约0.2-0.3厘米，输尿管宽约0.6-0.7厘米，狭窄处仅约0.3厘米左右），因此超过其开口直径的结石很难被排出体外。同时人体结石一般质地比较坚硬，组成成份复杂药物很难将其溶化，因此排石溶石疗法的疗效受到了局限。