文件和文件夹是否都能设置NTFS权限？权限的优先级别有哪些？合理利用权限能否制止病毒的运行或传播？

都可以。
小的比大的优先，就是文件比文件夹优先，而文件夹又比磁盘优先。
可以，因为，设置了权限的话没有得到权限的就无法访问，不过如果只是个人计算机的话效果低点，因为一般人都是只用一个内置的管理员帐户。