如何理解DNA微卫星?

来源:百度知道 编辑:UC知道 时间:2024/06/05 08:07:53

答:什么是卫星DNA?就是高度重复的DNA序列.
微卫星DNA是一种广泛分布于真核生物基因组中的串状简单重复序列,每个重复单元的长度在1—10bp之间,常见的微卫星如TGTG……TG= (TG)n或AATAAT……AAT= (AAT)n等,不同数目的核心序列呈串联重复排列,而呈现出长度多态性。
微卫星的优点:
(1)微卫星DNA数量多且均匀分布在基因组中。据估计,在基因组中平均30—50kb就存在一个微卫星,为在整个基因组中定位更多的基因提供了极大的方便
(2)微卫星DNA具有丰富的多态性,并且微卫星位点检测可以显示纯合子和杂合子。
(3)微卫星检测容易、重复性较好、省时,适合于进行自动化分析。通过GeneScan检测,一个位点的检测一般可在24h内完成,且可同时进行多位点的检测。

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卫星DNA(satellite DNA)是一类高度重复序列 DNA在介质氯化铯中作密度梯度离心,离心速度可以高达每分钟几万转;此时DNA分子将按其大小分布在离心管内不同密度的氯化铯介质中,小的分子处于上层,大的分子处于下层;从离心管外看,不同层面的DNA形成了不同的条带。根据荧光强度的分析,可以看到在一条主带以外还有一个或多个小的卫星带。这些在卫星带中的DNA即被称为卫星DNA,这种DNA的GC含量一般少于主带中的DNA,浮力密度也低。
卫星DNA按其浮力密度的大小可以分成I、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四类,其浮力密度分别是1.687,1.693,1.697和1.700 g/cm3。各类卫星DNA都是由各种不同的重复序列家族所组成。卫星DNA通常是串联重复序列。卫星DNA按其重复单元的核苷酸的多少,可以分为两类。一类是小卫星DNA(minisatellite DNA),由几百个核苷酸对的单元重复组成。另一类是微卫星DNA(microsatellite DNA),由2个到20个左右的核苷酸对的单元重复成百上千次所组成。卫星DNAI家族由42bp的单元组成,其中17bp(ACATAAAATAT AAAGT)为可变区,25 bp(ACCCAAAAAGT TATTATATACTGT)为重复单元。卫星DNAⅡ家族是保守性差的ATTCC重复。卫星DNAⅢ是较保守的ATTCC重复,且与10bp的序列(A T