结界师的动漫与漫画是分别在哪集开始不一样的？

基本一致，但是在动画后面已经出现了不同。

比较明显的是《悲哀的妖花》、《最后的决战》、《良守与火黑》最近的几集里，对黑芒楼的几位大将的背景和结局做了补充，是漫画里没有提到的。
而最早不一样是从时音追着良守进黑芒楼的异世界开始的，漫画里时音没有进入异世界，影宫闪的戏份在动画里也有显著增加。