关于考研档案问题

我是在南京上学的本科生，07年毕业，毕业后在江苏常熟一家企业工作，在试用期内辞职,辞职后一直没找工作，住在南京复习09年考研。目前档案还在常熟人才市场，户口迁移证（上面写的是常熟的单位地址）则一直在我手里。我听朋友说如果一直没有落户的话户口就会返回学校所在地（南京）。那么：
（1）档案在常熟，户口在南京，档案和户口分隔两地会不会对报名考研不利？我需不需要把档案转到南京呢？
（2）如果转到南京，怎么转？
（3）我09年才考研，那时候离毕业也接近两年，我的户口档案还可以在南京么？我是湖南人。
如果知道的朋友请告诉我，感激不尽！我报考的是南京的大学。

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