我新开了家超市,资金大概在13万左右,请问我在注册资金的时候填多少?与纳税有什么关系.

工商登记的营业执照上有，按上面填写即可，按规定在工商登记后15天必须去税务登记

开超市应当向国税部门申报缴纳4%的增值税，向地税局申报缴纳增值税的7%城建税和3%教育费附加，以及个人所得税2%左右。如果月销售收入在5000元以下的，免征增值税、城建税、教育费附加。
税务部门对个体工商户一般都实行定期定额办法执行，也就说会按区域、地段、面积、设备等核定给你一个月应缴纳税款的额度。

按个体工商户申报，注册资金写个三五万够了

怎么小怎么申报（比如营业额，实际1000，你说300，）

税一般是核定的，一般不会有人找你要票的