我是北京在校硕士研究生，男朋友是博士已经参加工作有了北京户口，

不会有太大的问题吧，你不会想要去更远的城市工作吧？？？不过有一点值得注意的是，用人单位是不是喜欢已婚的，不同的用人单位不一样。不过我觉得已婚的还是比较稳定的。这样的人比较踏实，成熟嘛。

户口主要表示经常居住地。北京户口的主要条件是在北京有合法常住地，跟职业没有必然联系。有户口未必有工作，有工作者未必有户口。
你现在在北京读硕士研究生，就是北京户口了。跟是否领结婚证无关。具有北京户口，对于在北京就职无疑有利。但是你若去北京以外地方就职，是否北京户口没有关系，关键是你的知识和技能。户口不是终身制，而是根据常住地而改变的，可以自己选择。过去政府安排就业，户口跟职业关系密切。如今都是市场决定，户口与职业联系很淡薄了。

我男朋友也是要和我结婚，可是我害怕会影响我日后找工作，所以我拒绝了

没问题